通常，不管是黄芪还是黄芪提取物，我们在使用的时候都是相对安全的；不过口服时，黄芪提取物可能引起皮疹，皮肤瘙痒，鼻腔或胃部不适以及头晕或心律不齐。但是，这些事件并不常见。
黄芪提取物中多糖与人参总皂苷联用能明显提升小鼠外周血白细胞数量和免疫指数。现代药理研究表明，黄芪具有增强心肌收缩功能，其中黄芪所含的毛蕊异黄酮对血管内皮细胞有保护作用。黄芪还对肝脏、、胃及其肺脏等具有一定的保护作用。能阻止肝糖原减少，黄芪植株中因含有微量元素硒，还可间接激活肝脏酶系，从而起到保护肝脏的作用。黄芪在肝、结肠、肺、乳腺等恶性肿中具有显著的抑制作用，能够抑制乳腺细胞和结肠细胞增殖，促进肿细胞程序性。黄芪还具有一定的作用，能消除体内自由基，延缓衰老。黄芪甲苷可保护线粒体且降低Cytc 的胞浆释放量，阻断线粒体凋亡途径。另外黄芪还具有一定的保护、、抗疲劳、、抗病毒等作用。黄芪提取物含有丰富的黄酮类化合物。实验研究表明：黄芪提取物能明显降低小鼠耳肿胀程度，减少小鼠对冰醋酸的扭体反应次数，结果说明黄芪提取物具有明显的、镇痛作用，且以大剂量效果更明显。
具有力，增强能量，抗疲劳，抗突变，保肝，抑制破骨细胞的作用。黄芪多糖具有降血脂，即降低胆固醇和甘油三酯、升高高密度脂蛋白的作用；能够预防和心脑血管疾病，如动脉粥样硬化、冠状动脉病变、周围血管病变以及高脂血症等。黄芪甲苷具有显著降低血糖、糖化血红蛋白和尿蛋白的作用，可降低肾皮质和血清中的AGEs，显示黄芪甲苷具有抗氧化作用，并对醛糖还原酶有抑制作用，还有抑制系膜细胞增生、减轻肥大的作用。在黄芪甲苷中加入适当辅料，可制成口服制剂，它用于预防和肾病。
在传统药理的基础上，人们还发现了其具有抗肿，病毒的作用。通过研究发现，黄芪提取物的重要成分为黄芪多糖，它对结核菌感染有明显对抗作用；而已发现其它成分如、生物碱、黄酮等具有显著抗滤泡生口腔炎病毒的作用。
