打了疫苗发病，主要有以下几种情况：
1.母源抗体的干扰。多数病毒性和部分细菌性烈性传染性猪病母猪免疫后，仔猪在母源抗体水平较高时进行同种疫苗的免疫，会受到母源抗体的干扰。如猪瘟免疫规范的母猪，出生仔猪获得的猪瘟母源抗体持续28天后开始快速下降，猪蓝耳病母源抗体持续21天，仔猪出生一周内免疫以上疫苗会受到母源抗体的严重干扰，无法产生预期的免疫效果。
2.免疫操作不规范。疫苗免疫过程中，注射部位不准确、不消毒，注射深度不够，针头不按猪龄选择长度，不更换针头一针到底，甚至还打飞针，皮下、皮内、肌肉注射分不清等问题比较普遍，导致免疫后抗体水平不整齐或不合格，疫苗免疫后不能起到较好的保护效果。
3.疫苗质量因素。疫苗质量直接影响免疫成败。猪常用疫苗种类多达10多种。疫苗的保存、运输、稀释、使用等环节，也能造成疫苗变质、效价下降，导致免疫失败。
4.免疫抑制的影响。免疫抑制是在外界因素作用下，免疫组织器官受到损伤，免疫细胞呈递抗原能力受到阻断和抑制，机体免疫应答不全，在低致病力和弱毒病原的感染下都能引发疫病。造成机体免疫抑制的因素很多，如霉菌毒素、重金属、放射性辐射、应激因素、营养不全、维生素缺乏以及蓝耳病和猪圆环病毒病等。目前免疫抑制在猪群中普遍隐性存在，不同猪群免疫抑制程度不同而已，猪场应高度重视免疫抑制现象，做好相应的预防和控制。
5.饲养管理因素。营养不全价、设施设备不健全、猪群生活环境较差，生长所需的营养得不到满足，机体健康水平得不到保障。因此，免疫接种后猪群抗体水平不能达到预期水平和保护力，导致猪群免疫失败，易引发突发性重大动物疫情。
6.注射疫苗前，该种病处于潜伏期，免疫后发病。
要预防免疫失败，应做好以下几个方面的工作：
1.科学饲养管理，提升健康水平。养猪场要围绕自繁自养、全价料饲养、程序化免疫、制度化消毒、科学化用药、保健性防疫等科学的饲养管理来提升猪群健康水平。
2.免疫与监测相结合，避免盲目免疫。传统的养猪场（户）认为注射了疫苗就万事大吉，而且对免疫接种和采样监测有排斥性。免疫和监测是相辅相成的，通过监测可以确定仔猪首免时间，根据监测结果评价免疫效果，制定补免时间，利用监测来预测一些疫病的潜在威胁。对猪群不同时期的跟踪监测是科学合理地制定免疫程序的依据，可以避免免疫的盲目性，确保免疫的时效性。科学的监测能避免母源抗体的干扰，发现病原微生物的隐性感染，避开疫苗间的相互干扰，提升免疫质量。
3.避免免疫抑制，消除潜在隐患。猪群免疫抑制现象普遍存在，而且逐步成为影响猪群健康的重要因素。免疫抑制是机体破坏免疫系统抵抗的一种无形杀手，但也是可以避免和控制的。使用正规厂家生产的饲料，控制饲料霉变因素；监测水源、饲料的重金属含量、放射性射线的污染等物理因素；淘汰病原性免疫抑制猪只和猪群，控制病原性免疫抑制因素；根据不同年龄饲喂不同营养价值的全价饲料，提高免疫力；加强疫病监测、减少转群等应激，消除疫病和应激造成的免疫抑制现象。
4.疫苗保质保量，确保免疫效果。疫苗质量低劣和不规范操作是免疫失败的重要原因。选择正规企业生产或政府采购疫苗，使用匹配的稀释液和规定稀释度进行疫苗稀释，稀释后要在规定的时间内用完，否则不能再使用。疫苗注射时按照说明书所述的免疫剂量、注射部位、注射方式进行免疫，免疫前后停用抗生素5天左右，确保细菌性疫苗免疫后不被清除；接种时按猪只大小选择不同规格的针头，并避免漏免，保证疫苗免疫的质量和效果，减少免疫失败的发生。